Özel dizayn edilmiş dönüştürücüler kullanılarak dönüştürücü hastanın vajinası içine yerleştirilerek ultrason yapılabilir. Bu yöntem ile karından yapılandan daha iyi görüntüler alınabilir. Özellikle kilolu gebelerde ve erken gebelik haftalarında çok kullanışlıdır. Daha iyi görüntü elde etmek için dönüştürücü hedef organa mümkün olduğunca yakın olmalıdır. Vajinal yoldan yapılan ultrasonda da dönüştürücü rahime, olabileceği en yakın pozisyondadır. Vajinal yoldan yapılan ultrasonda bebeğin kalp atışı karından yapılana göre 1 hafta daha erken gözlenir.
Dış gebeliğin erken tanısında da vajinal ultrason yeri doldurulamaz bir öneme sahiptir.
İlk haftalarda vajinal ultrason ile bebekteki bazı hastalıkların da tanısı konabilir. Bazen ilerleyen haftalarda da bebeğin bazı hastalıklarına ilişkin detaylara bakılması için vajinal ultrason kullanılabilir.